当下的中国，除了个别地区，整体宗教氛围并不浓厚。但是在历史上，尤其是南北朝时期，宗教在中国得到大发展，其中佛教最为盛行。
唐朝的杜牧曾在七绝诗《江南春》中写到：“南朝四百八十寺，多少楼台烟雨中。”诗中所描述的江南，到处是香烟缭绕的寺庙，亭台楼阁矗立在朦胧的烟雨之中。尽管在现如今，我们已经无法再直观的感受那般场景，但是在“蟹乡”巴城，我们似乎还能寻找到，那个梵音渺渺时代遗留下的香火余烟。
南北朝时期梁天监八年（公元509年），有“皇帝菩萨”之称的梁武帝在江南敕建了一座新的寺庙，这便是崇宁寺。梁武帝，即萧衍，南梁开国皇帝，虔诚的佛教徒，多次舍身出家。
民国时期的巴城地方志《巴溪志》曾载：“夫十朝古刹，一方香火，福国佑民”，从梁武帝敕建算起，崇宁寺已经历了1500多年的风风雨雨，将崇宁寺称为“十朝古刹”毫不为过。
1500年终究是非常漫长的过程，崇宁寺也如万事万物一样，在千余年间经历着各种起伏变故，历代屡有兴废。事实上，今日我们所见的崇宁古寺所在地并非原址。崇宁寺最早的地址位于现在的巴城老街北侧，即巴城小学所在地。崇宁寺最早也并非寺，而是庵。直到明天顺八年即公元1464年，“戒行精严，勤于禅学，以仁善化人，以道德律己”的苏杭名僧存鼎重新扩建，才将名字改为今日所称的崇宁寺。
当时的崇宁寺，前有山门，置四天王与石弥勒佛，后隔园地，雄峙正殿，旁置巨钟，正殿设两庑廊厢，座罗汉五百尊。后殿石级石柱。寺北偏西有佛楼斗姆阁，东为僧舍神殿20余间。整个寺刹高大恢弘，气势非凡。明弘治十三年（公元1500年），又得以重修，是当时昆山著名的佛教丛林之一，法事活动频繁，在信徒中有着较高的地位。
根据《巴溪志》的记载，当时的崇宁寺西临巴城湖，北望古虞山，风光独秀。一篇名为《禅寺钟声》古诗中曾写到：“古寺白云封，红尘隔几重。一僧清早起，敲动景阳钟”。描绘了寺僧晨起敲钟的日常生活情景，这也就是古时“巴溪八景”即“巴城八景”——之一的“禅寺钟声”。（注：巴溪八景：“虞山积雪”“玉岫行云”“阳澄烟雨”“笠浦风帆”“湖亭月色”“禅寺钟声”“芦滩落雁”“塘岸网鱼”）
崇宁寺后又经日寇侵华，毁于战火。1983年8月巴城小学建教学大楼时，将最后所剩的后殿拆除，至此，殿宇全部毁之无存。千年古寺最后成为孩子们接受教育和享受童年的场所，对于佛来说，应该是最希望看到的结果。
然而事实上，崇宁寺的香火并没有因此熄灭。2002年，在多方努力下，崇宁寺易地重建，2005年9月25日举行了隆重的落成典礼暨玉佛开光仪式，原中国佛教协会会长、现名誉会长一诚法师为新寺题匾，这便是今天我们所看到的崇宁古寺。
崇宁古寺位于阳澄湖畔，建筑风格采用明代样式。寺前的觉悟桥及飞檐斗拱的天王殿、大雄宝殿和藏经楼，雄踞守寺大院的中轴线，东边是曲椽弧顶走廊的僧舍及装修典雅而现代的僧人学习室。
西边是玉佛阁，四根名贵巴西红木立柱高撑，阁上藻井庄严华丽，内供有近两米高的缅玉玉佛。寺西侧临湖之畔，建有佛光山庄一座，馨和素雅、清朗大气，可供游客起居之用。古寺新韵、风景奇绝、水天一色、梵呗天乐，既显佛地之悠远清韵，也便游人之休闲怡情。
明代吴门画派著名画家沈周在《夜宿崇宁寺》诗中有云：“佛座庄严苔借碧，僧窗点缀叶留红；灯临浊酒三更月，棹倚重湖叠浪风。”描写出了崇宁古寺深夜良宵人天俱寂的幽雅风致，如今抚贤追思，犹令今人心下思慕、感慨神往。
如今佛门信众和游人旅者进入古刹，则会举首凝望临湖牌坊上题刻：“欲植净因莫问他处，思归正道且入此门”，闻此清凉禅语，定会使人顿生参佛之心。走出古寺时，也必会注视牌坊上楹联：“娑婆有尽莲台在望，苦海无边回头是岸”，临别之际再度聆听此金玉良言，则会使归人在兴尽返程之时遐思迩想、回味绵绵。
